步驟9：若有身心障礙特別扣除額，需點選「選擇身心障礙人士身分」，接著扣除額資料自動加總如下圖，按下一頁。

步驟10：系統自動計算最有利的繳納方式如下圖。

步驟11：若有投資，輸入「投資抵減稅額明細」後按下一頁。

步驟12：若有「重購自用住宅」，請輸入重購自用住宅明細，否則按下一頁。

步驟13：若在大陸地區有所得，請輸入「大陸地區所得稅扣抵明細」，否則按下一頁。

步驟14：申報綜合所得稅時，未適用投資抵減獎勵，且沒有「特定保險給付」、「有價證券交易所得」、「非現金損贈扣除額」及「員工分紅配股時價超過面額部分」等應計入基本所得額之項目者，不必申報基本稅額，就算有上述應計入基本稅額的項目，若基本所得未超過六佰萬也不需要填基本稅額，直接按下一頁。

步驟15：選擇繳稅或退稅方式，填入明細後點選「產生二維申報書」，即可列印申報書並存檔。

步驟16：印出的二維條碼電子結算申報書如下圖。